bootstrapを実施する

boo.vpa(
  res,
  type = "index",
  B_ite = 5,
  method = "p",
  mean.correction = FALSE,
  B_cv = 0.2,
  ess = 200,
  out = "simple"
)

Arguments

res

vpaの出力値

type

"index": 資源量指標値についてブートストラップ。"caa": 年齢別漁獲尾数についてブートストラップ

B_ite

ブートストラップ法でのイタレーション数

method

`type = "index"`の時に利用可。"p": パラメトリックブートストラップ。"n": ノンパラメトリックブートストラップ。"r": 残差をスムージングした後ブートストラップt法

mean.correction

デフォルトは`FALSE`。対数正規分布の平均値の補正の有無。`type = "index"`と`type = "caa"`のいずれでも利用可能

B_cv

`type = "caa"`の時に利用可。漁獲量の変動係数(i.e. 対数取った漁獲量の分散)。

ess

`type = "caa"`の時に利用可。多項分布の有効サンプルサイズ。

out

"simple" 推定結果のみ保存する "full" インプットデータを含めてすべて保存する

See also

https://ichimomo.github.io/frasyr/articles/Diagnostics-for-VPA.html