再生産関係のレジームシフトを隠れマルコフモデルで推定する

Tang et al. (2021) ICESJMSの論文を改変

hmm_SR(
  SRdata,
  SR = "BH",
  k_regime = 2,
  gamma = 0.01,
  b_range = NULL,
  p0 = NULL,
  overwrite = FALSE,
  max.ssb.pred = 1.3
)

Arguments

SRdata

get.SRdataで作成した再生産関係データ

SR

再生産関係 ("HS": Hockey-stick, "BH": Beverton-Holt, "RI": Ricker)

gamma

SR="Mesnil"のときに使用するsmoothing parameter

p0

optimで設定する初期値