レトロスペクティブ解析の実施

レトロスペクティブ解析の実施

retro.est(
  res,
  n = 5,
  stat = "mean",
  init.est = FALSE,
  b.fix = TRUE,
  remove.maxAgeF = FALSE,
  ssb.forecast = FALSE,
  sel.mat = NULL,
  grid.add.ini = NULL,
  grid.init = NULL,
  remove.short.index = -1
)

Arguments

res

VPAの出力

n

除く年数

b.fix

b推定してる場合にbを固定するかどうか

remove.maxAgeF

Mohn's rhoを計算する際に最高齢のFを除くか（alphaを仮定して計算していることが多いから）

ssb.forecast

Mohn's rhoを計算する際にSSBは1年後を計算するか(last.catch.zero=TRUEのときのみ有効)

grid.add.ini

add.p.iniをgridで変えて初期値を事前に探索する

grid.init

p.initでgridを変えて初期値を事前に探索する

remove.short.index

年数が指定された数字以下になった指標値を除いて計算する(初期設定:-1)